middle down liquid chromatography–mass spectrometry (LC-MS) analysis
Russian translation: см.
| 14:57 Feb 20, 2024 |
| English to Russian translations [PRO] Science - Biology (-tech,-chem,micro-) / хроматография� | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
| ||||||
|  Selected response from: Marlin31 Russian Federation Local time: 11:47 | ||||||
Grading comment
| |||||||
| Summary of answers provided | ||||
|---|---|---|---|---|
| 3 +1 | см. |
|
Answers
4 hrs confidence: 
peer agreement (net): +1
peer agreement (net): +1| middle down liquid chromatography–mass spectrometry (lc-ms) analysis см. Explanation: Термин не такой уж и новый, но единого варианта перевода нет. Их три. Перечислю в порядке повышения, на мой взгляд, "веса" соответствующего перевода. 1. Без перевода, просто английский термин middle-down. http://pbmc.ibmc.msk.ru/ru/article-ru/PBMC-2023-69-1-5/ (доступна только английская версия, русскую приходиться "выщипывать" по фрагментам). Подход middle-down является производным top-down и представляет собой промежуточную версию между top-down и bottom-up (рис. 5). https://rscf.ru/prjcard_int?19-14-00306 При исследовании крупных биомакромолекул (>100кДа) и их комплексов в нативном состоянии методов Top-Down, Middle-down необходимым является повышенная разрешающая способность масс-спектрометра. https://cyberleninka.ru/article/n/metody-obrabotki-mass-spek... Для идентификации белков по масс-спектрам используют два метода: поиск по базам данных и de novo секвенирование. При масс-спектрометрическом анализе пептидов и белков различают три подхода [10]: «top-down», «middle-down» и «bottom-up». 2. Метод/подход/анализ "с середины вниз". https://cyberleninka.ru/article/n/proteomnye-metody-razdelen... Из-за сложности метода toр-dоwn появился подход «с середины вниз» (middle down), который называют протеомным анализом в расширенном диапазоне (ERPA — extended range proteomic analysis). Метод заключается в неполном протеолизе исходного белка с последующим масс-спектрометрическим анализом длинных пептидов методом «сверху вниз». Такие пептиды позволяют получить информацию о местах посттрансляционных модификаций, идентифицировать конкретные изоформы [27]. http://www.issp.ac.ru/ebooks/conf/VMSO_2017.pdf с.121 De novo секвенирование антител по данным «расширенной масс-спектрометрии снизу вверх» с использованием протеазы Sap9. В настоящее время масс-спектрометрия является основным методом, используемым для анализа белков и пептидов. Наряду с классическим ее подходом «снизу вверх» (bottom-up), все более широкое распространение получают методы «сверху вниз» (topdown) и «с середины вниз» (middle-down)... https://www.chem.msu.su/rus/vmgu/234/353.pdf Относительно новым подходом, разработанным с учетом сильных сторон BU и TD, стал «middle-down» (MD), или «от середины – вниз», названный по аналогии со «сверху-вниз» (рис. 4). В этом подходе при гидролизе белков генерируются значительно более длинные пептиды, чем типичные пептиды для BU, которые впоследствии анализируются с помощью ЖХ-МС/МС. http://www.bmc-rm.org/index.php/BMCRM/article/view/5/6 Результаты предварительных экспериментов подтверждают возможность использования метода Twister и для обработки данных масс-спектрометрии “с середины вниз” (middle-down) высокого разрешения: https://cyberleninka.ru/article/n/metodologicheskie-aspekty-... (тут дано более детальное описание подходов на русском и английском) Подавляющее большинство экспериментов с протеомикой предполагает процедуру переваривания белка в пептиды перед анализом МС. Анализ пептидов имеет несколько преимуществ перед белками, включая более эффективное разделение жидкостной хроматографией (LC), более низкую молекулярную массу и меньшее количество зарядовых состояний, что приводит к улучшению чувствительности [41]. В зависимости от размера полученных пептидов подход может называться «снизу вверх», либо «с середины вниз». В стратегии «снизу вверх» белок гидролизуется в пептиды в пределах ~ 500–3000 Да. Эти пептиды затем анализируют с помощью жидкостной хроматографии с электрораспылительной ионизацией MS (LC-ESI–MS) или методом лазерной десорбционной ионизации с времяпролетным МС (MALDI-TOF-MS). Идентификация белка выполняется на основе анализа отпечатков пальцев в пептидной массе или пептидной последовательности [34]. Секвенирование пептидов может быть эффективно достигнуто путем диссоциации, вызванной столкновением (CID), в более широкодоступных масс-спектрометрах ESI-ион-ловушки и ESI-QTOF или с использованием MALDI- TOF / TOF приборов [30]. Переваривание сложного образца белка, например целого протеома с «снизу вверх» подходом, дает огромное количество пептидов, и даже больше, чем может анализировать даже самый эффективный инструмент. Сложность набора пептидов может быть уменьшена без ущерба для информационного содержимого за счет получения меньшего количества, но больших по размеру пептидов. Это, так называемый, средний уровень протеомного подхода, сочетает в себе лучшее из нисходящего и восходящего, используя преимущества усовершенствованной измерительной аппаратуры MS и доступность методов фрагментации на основе 3. "Средненисходящий анализ/подход/метод" Смотрим еще раз последнее предложение из предыдущего пункта. Это, так называемый, средний уровень протеомного подхода, сочетает в себе лучшее из нисходящего и восходящего. То есть, bottom-up - восходящий анализ, top-down - нисходящий, а middle-down - средний или, иначе, средненисходящий, как здесь (метод другой, но подход аналогичен): http://www.niboch.nsc.ru/lib/exe/fetch.php/ru/events/defence... с.15 Помимо этого, существует несколько сценариев обмена водорода на дейтерий «восходящий» (bottom-up), «нисходящий» (top-down), «среднесходящий» (middle-down) (рис. 3). Для полноты картины, смотрим первый слайд тут: https://ppt-online.org/698343 Подходы к анализу в протеомной масс-спектрометрии I. “Восходящий” анализ – Bottom-up гидролиз белка/белков, масс-спектрометрия малых пептидных фрагментов II. “Нисходящий” анализ – Top-down анализ без гидролиза (интактные протеины) III. Middle-down гидролизат состоит из более крупных пептидов Т.е., средненисходящий ВЭЖХ-МС анализ, имхо, был бы неплохим вариантом перевода. В скобках или сноске можно, при необходимости, дать расширенную трактовку. Второй возможный вариант - ВЭЖХ-МС анализ методом (с использованием подхода) с середины вниз. Но меня слегка коробит от такой прямолинейности. -------------------------------------------------- Note added at 4 час (2024-02-20 19:48:20 GMT) -------------------------------------------------- P.S. Написал ВЭЖХ-МС, хотя в оригинале LC-MS. Обычно МС комбинируют с ВЭЖХ, но, возможно, что в данном случае использовалась и обычная ЖХ (жидкостная хроматография). В таком случае надо заменить ВЭЖХ на просто ЖХ. |
| |
Grading comment
| ||
| Login to enter a peer comment (or grade) | ||
Login or register (free and only takes a few minutes) to participate in this question.
You will also have access to many other tools and opportunities designed for those who have language-related jobs (or are passionate about them). Participation is free and the site has a strict confidentiality policy.
KudoZ™ translation help
The KudoZ network provides a framework for translators and others to assist each other with translations or explanations of terms and short phrases.
See also:
Search millions of term translations